「キーボードショートカット設定済みのスニペット」のスニペット名をリネームすると、対象のキーボードショートカットが不能になるようです。
確実にリネームする際は以下の手順で行います。

 

[操作手順]
→Dreamweaver起動
→Shift＋F9 を押してスニペット窓を開く
→対象スニペットをマウス選択する
→右クリック＞キーボードショートカットの編集 の順にアクセスする
→対象スニペットを選択し、ショートカットを解除する（- マイナスアイコンで削除する）

→Dreamweaverを再起動する
→スニペット窓より、対象スニペットを右クリック＞名前の変更、または編集 の順にアクセスする
→リネームする

→Dreamweaverを再起動する
→スニペット窓より、対象スニペットをマウス選択する
→右クリック＞キーボードショートカットの編集 の順にアクセスする
→対象スニペットを選択し、ショートカットを再登録する

以上で完了です

 

[確認環境]
Windows 7 SP1 64bit
Dreamweaver CS3 9.0