メインとなる *.ai の他に、リンク配置されている画像ファイル（*.ai から読み込まれている画像ファイル）を同フォルダ上に置く必要があります。
リンク配置されている画像ファイルが存在しない、ファイル名が異なる、ディレクトリ構造が異なるなどで以下のダイアログが現れます。

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「～～～～～～」というリンクファイルが見つかりません。見つからないファイルを探す場合は「修復」、別のファイルを選択する場合は「置換」を選択してください。リンクをそのまま変更しない場合は「無視」を選択してください。

□すべてに適用　　[修復]　[置換]　[無視]　[キャンセル]
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[操作手順]
→一度、[キャンセル]を押してIllustratorを終了する

→リンク配置されている画像ファイルを想定して、ファイル名、ディレクトリ構造をエクスプローラ上で点検、修正する

→再びIllustratorを開き、問題が解消しないようなら、ダイアログの [修復]、[置換] で代替画像を読み込む。

→代替画像がないようなら [無視] で開く。（この場合、リンク配置されている画像は表示されない）

 

[確認環境]
Windows 7 SP1 64bit
Illustrator CS3 13.0