1.Dreamweaverを起動します。

2.ファイル窓にアクセスして検索対象のサイトを開きます。
※ファイル窓はF8（トグル）で表示できます。

3.結果窓にアクセスしてリンクチェックを開きます。
※結果窓はF7（トグル）で表示できます。

4.左部にある「緑色の三角アイコン」をクリックして、「現在のローカルサイト全体のリンクチェック」を選択します。

5.「破損リンク」と表示されているメニューを「単独ファイル」へ変更します
※デフォルトは「破損リンク」になっています。

6.どこからもリンクされていないファイルが検索表示されます。

7.不要なファイルを選択してDeleteキーを押してファイルを削除します。
※Ctrlを押しながら選択、またはマウスドラッグで選択することで複数選択が可能です。

以上で完了です。

[PC環境について]
Windows 7 SP1
Dreamweaver CS3 9.0